Nel protocollo d'intesa vengono individuati i tre assi che serviranno richieste differenti: sulla Chiasso- Como - Milano attraverso la trasversale del San Gottardo transiteranno i passeggeri, il traffico merci verrebbe smistato sul collegamento Lugano - Luino - Novara - Genova, mentre si vuole studiare una nuova direttrice che colleghi lo stato elvetico a Malpensa passando per Mendrisio.  

La divisione tra traffico merci e passeggeri,che costerà 18 miliardi di lire, è stato motivato dal ministro Bersani con l'intasamento delle linee: ogni giorno almeno un migliaio di convogli svizzeri passa la frontiera e le previsioni per i prossimi anni parlano di un incremento di almeno il 50%.  
L'Italia, quindi, è indirizzata a prediligere l'attuale linea Lugano- Como- Chiasso che sarà quadruplicata. 
Importante per la nostra provincia, infine, la decisione di studiare un collegamento tra Lugano e Malpensa che passi da Varese su una linea di collegamento da costruire e, che, quindi, non graverebbe sulle linee esistenti già molto affollate.